小智和皮卡丘来到丛林与一名神秘少年相遇。影片由矢岛哲生(《精灵宝可梦：大家的故事》)执导，7月10日在日本上映。

新学年开始，卫认识了刚转校的清纯女子林可可，另一方面，卫教授从非洲回来，发觉宝甲不翼而飞，逼问之下方知乃死对头龟仙人所为，但仙人却无法回忆起弃甲于何处。原来可可乃天魔转生，为探求宝甲下落，不惜吸取表姐